Janeway a Voyagerre való visszatértekor elmondja, hogy találkozott egy r'kaal nevű fajjal, akik megtiltották, hogy a Voyager térváltással haladjon át a területükön, ezért úgy döntött, hogy átadja a reaktormagot, és a legénységet letelepíti egy M típusú bolygóra. Chakotay teljességgel ellenzi ezt, és megpróbálja kideríteni, hogy mi történhetett a kapitánnyal. A parancsnok felfedezi, hogy a kapitány egy imposztor, aki erre elkábítja és elmenekül. A gyengélkedőn kiderül, hogy valójában a Doktor öltötte magára a kapitány alakját. A Doktort valójában egy idegen faj utasításait hajtja végre, akik túszul ejtették a kapitányt. A Doktornak a kapitányért cserébe meg kell szereznie a Voyager reaktormagját. Eközben Tuvok és Chakotay továbbfolytatja a nyomozást a titokzatos imposztor után.
A Voyager, a Föderáció egyik legmodernebb hajója, egy Maquis hajó nyomában járva a Delta Kvadránsba kerül. A Csillagflotta és a Maquis legénység egyesülve kezdi meg a hazafelé vezető 70000 fényéves utat az ismeretlen térségén át.
Janeway a Voyagerre való visszatértekor elmondja, hogy találkozott egy r'kaal nevű fajjal, akik megtiltották, hogy a Voyager térváltással haladjon át a területükön, ezért úgy döntött, hogy átadja a reaktormagot, és a legénységet letelepíti egy M típusú bolygóra. Chakotay teljességgel ellenzi ezt, és megpróbálja kideríteni, hogy mi történhetett a kapitánnyal. A parancsnok felfedezi, hogy a kapitány egy imposztor, aki erre elkábítja és elmenekül. A gyengélkedőn kiderül, hogy valójában a Doktor öltötte magára a kapitány alakját. A Doktort valójában egy idegen faj utasításait hajtja végre, akik túszul ejtették a kapitányt. A Doktornak a kapitányért cserébe meg kell szereznie a Voyager reaktormagját. Eközben Tuvok és Chakotay továbbfolytatja a nyomozást a titokzatos imposztor után.